ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE LA REGULACIÓN DE MICRO RNA Y mRNA EN CÉLULAS MONONUCLEARES EN SANGRE PERIFÉRICA DE PACIENTES CON EPOC

Se realizó un análisis mediante MICROARRAY de la expresión de miRNA y ARNm en PBMC de personas con enfermedad pulmonar obstructiva crónica y se comparó sus perfiles de expresión con fumadores sin limitación de flujo aereo.

Se uso:

• Agilent Human Gene Expression Microarray 4.0

¿Cómo?

• Se aislaron células mononucleares de sangre periférica  a partir de sangre venosa  por centrifugación.
• Integridad por electroforesis.

 Referencias: 
 1.- Dang, X., Baglole, C., Shang, D., & Chang,.Bioinformatic analysis of microRNA and mRNA Regulation in peripheral blood mononuclear cells of patients with chronic obstructive pulmonary disease. PUBMED [online] 2017 [citado  09 de Junio de 2018]. Recuperado a partir de:  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5217451/

2.- https://www.labmedica.es/patologia/articles/294768378/descubren-marcadores-geneticos-para-epoc.html 

PCR Y EL DÉFICIT DE ALFA 1 ANTITRIPSINA

El alfa-1 antitripsina es una sustancia proteica que controla y regula una infección dentro del pulmón, ¿Cómo? Asegurando que las proteasas que segregan los leucocitos durante una infección, lo hagan eficazmente, pues su descontrol haría degradar y afectar incluso al tejido sano.

1. Tema: ANÁLISIS MOLECULAR DEL GEN AAT

2. Objetivos: 

• Identificación de las variables alélicaspoco frecuentes y para la caracterización de algunas variantes nuevas.
• Identificar variantes nulas y para el estudio de casos en que no existe concordancia entre la concentración de alfa 1 antitripsina y el fenotipo.

3.- Muestras: EXTRACCIÓN DE ADN Y PCR

• A partir de moléculas mononucleares de la sangre 
• Secuenciación cíclica de los productos de PCR

4.- Tipo de Ácido Nucleico: ADN POR CRIBADO DEL DÉFICIT DE AAT EN MUESTRAS DE SANGRE SECA EN PAPEL

• Determinación a partir de sangre capilar, por puncióon esteril del pulpejo del dedo
•  Determinación de dos alelos deficitarios mas frecuentes S y Z

5.- Genes: alfa 1 antitripsina

6.- Tipo de PCR: PCR a tiempo real 

TÉCNICAS DEL ALELO ESPECÍFICO

• Técnica que informa la presencia o ausencia de los alelos mencionados 
• Basadas en PCR a tiempo real  son rápidas, automatizables,, bajo costo pero con genotipado parcial

Referencias: 

https://www.researchgate.net/profile/Jose_Alvarez-Sala/publication/246034223_EPOC_y_acontecimientos_cardiovasculares/links/5b8d481c45851540d1c219fe/EPOC-y-acontecimientos-cardiovasculares.pdf

https://id.elsevier.com/as/authorization.oauth2?platSite=SD%2Fscience&scope=openid+email+profile+els_auth_info+urn%3Acom%3Aelsevier%3Aidp%3Apolicy%3Aproduct%3Ainst_assoc&response_type=code&redirect_uri=https%3A%2F%2Fwww.sciencedirect.com%2Fuser%2Fidentity%2Flanding&authType=SINGLE_SIGN_IN&prompt=none&client_id=SDFE-v2&state=retryCounter%3D0%26csrfToken%3D563e28c3-9479-4a90-b165-2ff3c3b11ed1%26idpPolicy%3Durn%253Acom%253Aelsevier%253Aidp%253Apolicy%253Aproduct%253Ainst_assoc%26returnUrl%3D%252Fscience%252Farticle%252Fpii%252FS0300289610700247%26prompt%3Dnone%26cid%3Darp-b6b11288-c4e0-47fc-a215-bab1c9167697

PRUEBA DE TAMIZAJE Y CONFIRMATORIA DE EPOC

TAMIZAJE:

Serán direccionadas a analizar la capacidad vital y los diferentes cambios en la homeostasis del organismo.

CONFIRMATORIA:

Referencias: 

1.  http://www.archbronconeumol.org/es/esquema-seguimiento-epoc-estable/articulo/S0300289617303629/
2. https://www.atsjournals.org/doi/10.1164/rccm.201509-1722PP#citart1 

ALTERACIONES EN LA EPIGENÓMICA DE EPOC

EPOC es fundamentalmente inducido por el humo del tabaco, entonces esta es la principal fuente epigenómica de la enfermedad, Es entonces que dependiendo el tiempo que se expone a las células epiteliales bronquiales al humo del cigarrillo, pueden producirse cambios por alteraciones de la cromatina incluyendo marcación de genes para reprimirlos por una metilación anormal del ADN.

• ACETILACIÓN
• METILACIÓN 
• FOSFORILACIÓN

  

Exposición a:

 

 

VIDEO EDUCATIVO RELACIONADO  

 

 Referencias:

1.-  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28898697

2.- http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-99402013000100009&lng=es.  http://dx.doi.org/10.1016/j.acmx.2013.01.010. 

3.- http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=273849945015